Со своим городом Гортина Крит вместе с городом Кирена в Северной Африке стал частью современной протерианской провинции. Он управлялся проконсулом, который подчинялся провинциальному совету и системе магистратов. Древний город Кносс был сделан римской колонией не позднее 27 года до нашей эры, хотя эта дата является спорной. Остров лежал на пути, который связывал им с его Империей. Он делил восточную средиземноморскую культуру, передаваемую по торговым путям, и был процветающей территорией.
Это нашло свое отражение в крупных разбросанных поселениях в низинных или прибрежных районах, таких как Гортин, Кносс или Иерапитна (Иерапетра). Поселения включали в себя отельные виллы и фермы, неизвестные во время войны эллинистической эпохи. Многие объекты Крита, такие как Мохлос, были впервые заселены после бронзового века. Многое на острове говорит об искусстве колониальной Римской империи.
После 330 года нашей эры историки начали по-разному относиться к позднему римскому и раннему византийскому периоду. Триумф христианства и основание Константинополя императором Константином Великим ознаменовали начало византийской эпохи в Греции. С разделением Римской империи в 395 году для Крита было естественным стать частью восточной сферы влияния, глядя на новую имперскую столицу на Босфоре – маяк европейской цивилизации в течение столетий, когда западная империя находилась в упадке.
Архитекторы самых ранних церквей на Крите следовали сложившейся практике, придавая зданиям форму базилики. Стандартное римское общественное здание разделялось на три части внутренними колоннадами, а также были добавлены одна или три аспиды, чтобы сформировать святилище. Подавляющее большинство этих церквей были построены между 5 и 6 столетиями. Самым лучшим из сохранившихся зданий и наиболее архитектурно изощренным является Собор Святого Тита. А также интересной для туристов является церковь в Визари, которая была построена в конце 8 столетия, незадолго до арабского завоевания.